Muito simples, vá no seu minecraft e crie um mundo no "Singleplayer", dps vai nas opções e lá tem "Gerar estruturas" daí você coloca que nao e assim o mundo vai ficar sem as dungeons. Depois é só upar o mapa para o seu sv e usar.
Podia ter mais alguma inovação no plugin em si, ou então mais possibilidades como por exemplo na config definir se precisa da matadora para tal boss ou não.
Mas mesmo assim boa sorte .